3 июня 2009 года Комиссия Управления Федеральной антимонопольной службы по Новосибирской области (Новосибирское УФАС России) рассмотрела дела о нарушении антимонопольного законодательства администрацией р.п. Кольцово Новосибирского района Новосибирской области и АНО «Инновационный центр Кольцово». Администрация р.п. Кольцово, в нарушение части 1 статьи 15 Федерального закона № 135-ФЗ от 26.07.2006г. «О защите конкуренции», включила в свои акты (Программа «Поддержка инновационной деятельности и субъектов малого и среднего предпринимательства на 2008-2010г.г.»; Организационный план мероприятий муниципальной целевой программы; Положения о порядке предоставления субсидий по программе) финансирование отдельных хозяйствующих субъектов, предоставление субсидий субъектам, образующим инфраструктуру поддержки субъектов малого и среднего предпринимательства, инновационной деятельности, без установления критериев (категорий), требований отнесения к ним. Кроме того, администрация р.п. Кольцово нарушила статью 20 Федерального закона № 135-ФЗ от 26.07.2006г. «О защите конкуренции» путем предоставления муниципальной помощи АНО «Инновационный центр Кольцово» в размере 904 тыс. рублей без предварительного согласия в письменной форме антимонопольного органа. Администрация р.п. Кольцово и хозяйствующий субъект (АНО «Инновационный центр Кольцово») заключили соглашения и договоры о предоставлении субсидий в нарушении действующего законодательства, что является нарушением статьи 16 Федерального закона «О защите конкуренции», поскольку приводят или могут привести к недопущению, ограничению, устранению конкуренции. Комиссия Новосибирского УФАС России признала администрацию р.п. Кольцово и АНО «Инновационный центр Кольцово» нарушившими требования антимонопольного законодательства и приняла решение выдать администрации р.п. Кольцово предписание.
